全氟醚(Perfluoroether，简称PFPE)和氟橡胶(Fluoroelastomer，简称FKM)都是具有高性能的密封材料，但它们在化学结构、性能和应用领域上存在很大的差异。以下是全氟醚和氟橡胶之间的主要区别：

1. 化学结构：全氟醚是一种全氟烷基醚化合物，其化学结构中含有C-F、C-O和C-C键，几乎完全由氟原子覆盖。这使得全氟醚具有非常高的化学稳定性和热稳定性。氟橡胶是一种氟化合物高分子材料，化学结构上含有氟原子，但不像全氟醚那样完全氟化。
2. 耐化学性：由于全氟醚的完全氟化特性，使得其对酸、碱、溶剂和氧化剂等具有非常高的耐化学性，优于氟橡胶。氟橡胶虽然具有较好的耐化学性，但在某些特殊环境中可能受到限制。
3. 耐高温性能：全氟醚能在极宽的温度范围内工作，通常为-70℃至260℃，部分特殊PFPE材料可达到更高的使用温度。而氟橡胶的耐热性能较低，一般在-20℃到230℃之间。
4. 耐低温性能：全氟醚具有很强的低温适应性，在低温环境下可以保持良好的弹性和密封性。氟橡胶的低温性能一般，可能在低温条件下硬化而失去弹性。
5. 气密性：全氟醚具有非常低的气体渗透率，其气密性优于氟橡胶。
6. 价格：全氟醚的生产成本较高，所以价格通常也比氟橡胶昂贵。
7. 应用领域：由于全氟醚的耐化学性、耐高温性和气密性优于氟橡胶，因此全氟醚密封件更常用于航空航天、半导体、核工业、化学工业等领域。氟橡胶则常用于汽车、石油化工、制药等行业。
8. 总之，全氟醚和氟橡胶在结构和性能上有很大区别，适用于不同的密封领域。全氟醚适用于更严苛的环境，而氟橡胶则适用于一般工业用途。